El Prof. Aitor Mugarza es va llicenciar en Física el 1997 i va completar el doctorat en la mateixa disciplina el 2002, tots dos a la Euskal Herriko Unibertsitatea (Universitat del País Basc). Va rebre una beca Marie Curie per treballar com a investigador postdoctoral al Lawrence Berkeley National Laboratory (EUA) i a l'Institut de Ciència de Materials de Barcelona (ICMAB). Es va incorporar a l'antic Catalan Institute of Nanotechnology el 2007 amb una beca Ramón y Cajal. El 2013 es va convertir en el líder del grup de Manipulació Atòmica i Espectroscòpia a l'ICN2. Des del 2015 és professor d'investigació ICREA.
La seva activitat investigadora gira al voltant de l'estudi de fenòmens electrònics i magnètics quàntics a la nanoescala i el desenvolupament d'estratègies per a la seva manipulació amb precisió atòmica. Combinant tècniques de microscòpia d'efecte túnel amb espectroscòpia de radiació sincrotró, correlaciona fenòmens microscòpics amb observables macroscòpics per a la caracterització i el disseny de nous materials i dispositius. Actualment se centra en materials nous, com ara nanoestructures moleculars i de grafè, i materials quàntics 2D.